...
Откройте Панель управления Рутокен.
В раскрывающемся списке Подключенные Рутокен найдите и выберите пункт Рутокен ЭЦП 3.0 NFC Смарт-карта.
Если этот пункт есть, то считыватель и смарт-карта подключены корректно.
Если его нет, то отключите считыватель от компьютера и снова его подключите.
Если это не помогло, то переподключите смарт-карту.
Работа со считывателем в ОС Linux
...